顺应潮流：仅血浆ctDNA-MRD检验的应用前景！

"底物被扩及MRD侦测的发展潜力是说明的，想这些进展将在此之后大幅提低下一代MRD侦测的耐用开放性。"

癌症的MRD侦测是一种敏捷且特异的用于风险评估癌症病人血液之中源开放性遗传物质（如ctDNA）相对数量的法则。在这种状态下，病人没有太阳光可见的溃疡，但无论如何共存国际标准病理幻灯片法则不会侦测到但就此会造成了癌症罹患的表面溃疡。

MRD，经常称为表面湿气溃疡（Minimal Residual Disease）。运用于“Minimal” （表面）这个词，是因为它在古文献和病理专家之中更加经惯用。不过，“Minimal”这个词不太可能很强“误导开放性”，因为低准确度的病变在预后和病人权衡方面也不太可能很强最重要象征意义。“Measurable”（可量度）一词可更加恰当地描述湿气在病人母体的肿肉瘤细胞的共存。NCCN指南同时运用于了“Minimal Residual Disease”（表面湿气溃疡）和“Measurable Residual Disease”（可量度湿气溃疡）两个术语。

此除此以外，年前期工作暗示在分子可准确度上侦测多种癌症类型的ctDNA除此以除此以外很强病理好处，古文献和病理专家有时也会运用于“Molecular Residual Disease”（分子可湿气溃疡）一词。

近年来，国内除此以外在并不一定之中基于ctDNA的MRD风险评估（ctDNA-MRD）的病理资料和证据越来越多，开启了并不一定肉瘤MRD侦测的热潮。并不一定肉瘤ctDNA-MRD侦测的核心技术派别主要有两大类：

1）Tumor-informed assays（知情分析法则）

对原发许多分组织进行时人类基因分组计划以断定病人的特异等位基因分组变异图集，然后设计引物定制panel或运用于互换panel进行时个开放性化的ctDNA侦测分析法则。

2）Tumor-uninformed assays（发觉分析法则）

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays，即必需要原发许多分组织，非常少缺少四分组预先选定引物/探头设计的与癌症类型特别的互换panel进行时ctDNA侦测分析法则，经常在侦测ctDNA凋亡的同时，辅以ctDNA底物或片段分组学等的大学法则。弥补了许多分组织检验缺乏或风险评估启动子缺乏或TAT过长等问题。

Tumor-informed assays的核心技术策略更加符合大众的认知，在保证低等位基因表达的年前提下，可通过风险评估多启动子的sample-level（检验准确度）进一步大幅提低其孔径，核心技术门槛相对不是特别低。Tumor-uninformed assays的核心技术策略更加相似以前刨，通过大幅提低site-level（启动子准确度）侦测孔径并辅以ctDNA底物或片段分组学并联在手机器学习搜索算法进一步大幅提低其孔径和等位基因表达，核心技术门槛相对较高。

2021年4年初29日，《Clinical Cancer Research》因特网发表了“非常少运用于胆红素ctDNA侦测在手低血压病人表面湿气溃疡（MRD）”的文章，首次公开发表了Guardant Reveal的分析资料：MRD侦测孔径达到91%，等位基因表达达100%，这些挖掘单单支持了非常少胆红素ctDNA-MRD侦测（Tumor-uninformed assays）的潜在病理用于。

2021年8年初13日，《Clinical Cancer Research》因特网发表了“顺应潮流：非常少胆红素ctDNA-MRD侦测的用于年前途”的文章，在这里深入分析们咨询风险评估了非常少胆红素ctDNA侦测MRD的能力，以及将底物为基础到ctDNA侦测的潜在好处。2

Parikh及其合作者1 和Taieb及其合作者3 咨询了非常少胆红素ctDNA-MRD侦测在在手低血压（CRC）病人之中的潜在病理用于。

▲ ctDNA底物和凋亡在两项分析之中的用于相对（Parikh和Taieb）

在手低血压（CRC）的病人仍然陷入着一个挑战，即相当多的CRC病人因后期病因罹患而以致于死亡。尽管病理使用了国际标准的常规病人，但低风险IIIC期CRC病人的5年恰当率也非常少有53%，究其原因是没有挖掘单单除此以外科上没侦测到的表面湿气溃疡（MRD）。4

目年前，仍迫切并不需要要恰当考虑到哪些病人术后共存MRD，以帮助指导工作增大或缩减常规病人，并缩减治好的不太可能开放性，同时最大限度地增大过多病人的特别口服。

在只不过的几年里，我们对ctDNA在CRC病因和预后之中的用于有了相当多的了解。目年前，基于ctDNA的MRD风险评估恰巧相当多用于于癌症的病人之中。

ctDNA是由DNA的短片段分组成（大约130-150bp），由肿肉瘤细胞通过凋亡、坏死或表皮拘禁到循环系统之中。 ctDNA的寿命短致使其被选为引人注意的实时超载标志物，它的共存不太可能反映了除此以外科上看见的质重新分配。

在治好开放性病人在手束后，ctDNA之中单单现的肝细胞凋亡对随后的除此以外科罹患很强较高的感染开放性得单单实用价值，特别是当这些凋亡与开刀的许多分组织之中的凋亡特别联时。侦测这种ctDNA定义的MRD可以在I-III期CRC之中提年前除此以外科数年初得单单罹患，从而为四分组就此会罹患的CRC病人透过一个风险评估新疗法的售票处。然而，这些ctDNA政治体制凋亡定义的MRD侦测法则的孔径仍然是受限制的，迫切并不需要要小型化其侦测耐用开放性。

ctDNA的底物侦测比起ctDNA的政治体制凋亡侦测。ctDNA的底物异经常在CRC之中非经常当今型，并被认作大多数癌变的后期阶段。这种底物，具体情况定义为DNA之中半胱氨酸的C5后方添加甲基烷基，通气周围等位基因的表达，以除此以外当今的抑癌等位基因失活。与政治体制凋亡远比，CRC之中共存更加多的底物异经常区域，为大幅提低MRD侦测的孔径透过了机会。SEPT9，就是第一个利用血液侦测单等位基因底物异经常进行时刨查和后期侦测CRC的法则。尽管ctDNA底物有这些低费用，但这些相同的功能开放性也并不需要要谨慎，以维持侦测分析法则的等位基因表达，并尽量增大假感染开放性的不太可能开放性。

在这种背景下，Parikh和Taieb的原则上当年前分析在手果为我们对ctDNA耐用开放性的理解透过了有用的补充，即必需要原发许多分组织，非常少通过血液ctDNA底物或联合ctDNA凋亡才可进行时恰当的MRD风险评估。与其他并不需要要对原发许多分组织进行时人类基因分组计划以指导工作后续ctDNA分析法则的侦测不同，原则上分析论述了Tumor-uninformed assays的有效开放性，它有几个劣势，以除此以外快速的TAT，降低初始费用，对许多分组织缺乏或不能用的病人进行时风险评估。

Parikh等人透过了一种ctDNA底物联在手ctDNA政治体制凋亡的互换panel进行时MRD的分析法则风险评估（NGS法则），与其他商业性上能用的MRD侦测法则远比，这种法则不并不需要要开刀的许多分组织以及定制化。在就此病人后运用于时，这种非常少胆红素ctDNA-MRD侦测对罹患很强病理象征意义的等位基因表达（100%）和孔径（55.6%），通过为基础各部位等位基因分组构造和交叉风险评估分析法则，其孔径可进一步大幅提低至91%。1 该法则被用于打算进行时的年前瞻开放性分析，以除此以外指导工作IIA期在手肠癌病人权衡的NRG合作分组分析（NCT04068103）。虽然还并不需要要额除此以外的资料集来检验这些挖掘单单，但这些在手果表明基于ctDNA的MRD侦测在发觉的情形可放弃的侦测耐用开放性构造。

Taieb等人的分析利用了一对先年前被表明是CRC开刀后预后特别的底物等位基因上面物WIF1和NPY（ddPCR法则），并将它们用于于PRODIGE-GERCOR IDEA-France飞行测试，将III期CRC病人随机总称3个年初 vs 6个年初的常规化疗。在对受邀III期飞行测试的III期CRC病人进行时的首次ctDNA-MRD风险评估之中，有13.8%的病人术后为ctDNA-MRD感染开放性，并被认定为法理的预后标志物。3 同时，深入分析也指单单，与其他使用NGS法则的ctDNA-MRD分析远比，本分析之中ctDNA的感染开放性率较高。孔径和PPV除此以除此以外低于NGS侦测在手果，ctDNA-MRD感染开放性和复数的5年DFS共有65%和73%，尽管常规病人的和不单纯的年前分析法则检验处理方式不太有可能对这些在手果产生影响。该法则值得注意的是其相对有用，非经常低的费用和潜在的重现开放性，不并不需要要商业性侦测之中所见的知识产权侦测法则。打算进行时的年前瞻开放性分析将进一步风险评估非常少胆红素ctDNA侦测是否能够恰当风险评估MRD，以便对CRC病人进行时风险分层，并指导工作常规病人权衡。

无论使用何种法则，非常少用胆红素ctDNA-MRD侦测来指导工作CRC病人的病人决定，并不需要要有效且恰当的侦测法则。需要进一步大幅提低非常少胆红素ctDNA-MRD侦测的孔径来考虑到哪些病人可以从病人业余队之中获益，以避免不恰当地除此以除此以外低危病人放弃较高其中心的病人。Parikh及其合作者的分析在手果暗示，为基础等位基因分组和各部位等位基因分组以及交叉胆红素风险评估，可显著大幅提低非常少胆红素ctDNA-MRD的孔径。远比之下，ctDNA-MRD侦测的低等位基因表达对于ctDNA作为一个相对有用的动物标志物来考虑到病人适配是至关最重要的。由于等位基因表达缺乏，假感染开放性的ctDNA-MRD不太有可能使病人放弃过多的加强病人。Parikh及其合作者的分析在手果表明，除政治体制凋亡除此以外，还可以通过联在手各部位等位基因分组底物构造的分析法则来维持等位基因表达。Taieb等人的分析法则法则的劣势在于大幅提低了病理构造的孔径和预后，但是，恰巧如深入分析认可的那样，单独的两个等位基因底物上面不太可能不会透过与联在手政治体制凋亡法则的耐用开放性构造。最重要的是，这项工作也特别强调了国际标准化分析法则年前状况的最重要开放性，因为各种浓缩法则可以在很大总体上影响ctDNA的得率和相对有用开放性。在没来的分析之中，这些分析法则年前的考虑将更为越来越最重要。

底物被扩及MRD侦测的发展潜力是说明的，想这些进展将在此之后大幅提低下一代MRD侦测的耐用开放性。总之，非常少胆红素ctDNA-MRD的侦测透过了一个契合的机会，运用于一种无创法则来探求病人方案，并有不太可能消弭低危病人的质重新分配开放性溃疡。这些分析在手果无疑为没来ctDNA-MRD指导工作的年前瞻开放性病理飞行测试铺平了沿路。

MRD，仍然是一个快速发展的领域，我们预计近两年不太有可能单单现新的证据，要么显示单单MRD侦测的病理好处的局限开放性，要么显示单单MRD侦测的其他劣势和新用处。

参考资料：

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.